经过数年的隐忍发展，高丽水军又重新发展到五百余艘轻快战船七千水兵的规模。忽必烈为了牵制霹雳军，责令高丽攻击济州岛时，高丽王室百般推脱，任蒙元使者如何威逼利诱就是按兵不动。他们知道自己这点战船和水兵，在北海舰队面前根本就没有一战之力，更何况济州岛上还有霹雳军的陆战军。贸然进攻，不仅辛苦攒下的水军会全军覆灭，甚至招来灭国之祸。高丽王室狂妄而自卑，但他们却不傻。
当吴青率军在直沽登陆，北海舰队主力战舰尽数离开济州岛之时，高丽王室终于按捺不住心中仇恨了。在他们看来，霹雳军舰队强大，但绝不是蒙古人的对手。弃水师之长而登陆作战，更是必败无疑。由于信息滞后，此刻的他们并没有得到元军水师被霹雳军打残的消息，而是坚信霹雳军终将被蒙元军队荡平。既出于复仇的渴望，也出于向蒙元主子邀功的心理，更因为对财富和先进技术的觊觎，高丽王室下令水师倾巢出动，务求夺回济州岛。当下的济州岛，不仅有大片的粮田和养马场，还有工厂矿山和造船厂，甚至还一座兵工厂。作为北方公司的总部，这里商贸设施完善，港口仓库中堆放大量的药材、毛皮、腌鱼腌肉，海兽油脂和木材。
高丽人没有攻击耽罗港。他们知道港口只有寥寥几艘护卫船，城中守军也不过千人，但要塞和塔楼上却安放在威力巨大的火炮，即便顶着伤亡攻进港口，也攻不进这些坚固的防御工事。故高丽人将水军一部分停在了耽罗外海，以狼群战术袭击向直沽运送弹药粮草的运输船，大部分则在防御薄弱海岸登陆。济州岛虽然海岸陡峭，但也有不少地方可停靠小型船只。高丽水兵登陆之后，四处抢掠集镇、村庄和军马场。岛上的军力薄弱，只能守住耽罗城和少数据点。济州主政的王舜臣眼见情况不妙，只得收缩兵力防守。进攻济州的高丽军人数虽多，却对坚城利炮无可奈何。
不到半月时间，高丽军便控制了济州岛的大部分区域。他们攻不下耽罗城，便将气撒在手无寸铁的百姓身上。劫掠到的军马用船只运走，鸡犬猪牛杀了吃肉，金银财物和粮食统统打包带走，带不走的东西则全部付之一炬。高丽军极其残暴，比元军有过之而无不及，他们对济州岛上的人——不管是否高丽人，统统一视同仁。未来得及逃走的百姓遭了大罪——妇女被奸淫，青壮男子被掳为奴隶，老人儿童则被杀掉。
在高丽水军封锁之下，耽罗港不得不停止了向直沽运输粮草弹药。运输船即便侥幸冲出了港口，也会在路途之中遭到袭击。北海舰队的战舰一部分留在直沽，一部分前去攻打涟、海州等两淮元军，护航的战舰并不多。面对高丽水军飘忽不定的行踪和一击得手便退的狼群战术，护航战舰也是十分头痛，虽击沉了数十艘敌人的轻快船，但已方也损失了数艘大型运输船和十余艘中型运输船。这些船上满载的弹药粮草，对于通州和两淮前线的战事来说至关重要。
面对高丽的暴起发难，张宣急率北方舰队主力回援，黄大根也下令征调东海、北海甚至海参崴附近活动的几支私掠船队前往济州岛和小流求。之所以在济州危急之时，让私掠船队前往小流求，是因为后者也遭到了倭人的袭击。相对济州岛，小流求的面积更小，人口和驻军也更少，而倭人袭击者的人数更多，情况也更危急。据急报，袭击小流求的倭人不仅有海盗和萨摩藩的海商私兵，还有倭国的水军，总共有战船千艘水兵过万人。
倭国的天皇只是名义上的统治者，其实际权力掌握镰仓幕府之中。在向在向小流求进攻的同时，镰仓幕府掌权者北条时宗下令没收霹雳军在倭国的金银矿和伐木场，驱逐霹雳军使者。萨摩藩的领主也有样学样，将其领地内的霹雳军商号、货栈和商船全部没收，管理人员和水手皆被杀害。实际上，与霹雳军经商的这些年里倭国获益菲浅，经济也日益繁荣，萨摩藩更是借助倭国贸易中心的优势赚得盆满钵满。倭人之所以与霹雳军突然翻脸，除了受忽必烈的鼓惑，也是因为垂涎大小流求的财富与技术。他们深信元军与霹雳军决战，后者必然败北，眼下正是争抢大小流求的最好时机。
扬州城中的霹雳军高层得到这个消息皆异常愤怒，欧阳轩更是怒不可遏，当即下了三道法令：一是对于入侵济州和小流求的敌人，不投降者一律就地格杀；二是是宣布高丽和倭国不受霹雳军法律保护。这道命令看似苍白无力实则威力无穷，这意味着不管是霹雳军正规军还是私掠舰队，不管是士兵还是冒险者，可以在两国肆无忌惮的烧杀抢掠。后者本就无法无天，此令一