在成功化解“隐能”危机后，联盟与灵幻文明的合作步入了一个相对平稳且深入的发展阶段。
基于“灵暗能”的高效能源供应，一系列新兴产业应运而生。例如，“灵暗能”驱动的星际工厂能够在宇宙中任何地点快速搭建，生产出各种高科技产品。这些工厂利用“灵暗能”的强大能量，实现了生产过程的高度自动化和智能化，大大提高了生产效率。同时，在文化领域，联盟与灵幻文明的艺术融合达到了新的高度，创造出了许多令人惊叹的跨文明艺术作品。这些作品不仅在双方文明内部广受欢迎，还吸引了宇宙中其他文明的关注，进一步提升了联盟与灵幻文明在宇宙中的影响力。
然而，在这一片繁荣的背后，一些细微的迹象开始暗示着潜在的危机。联盟的宇宙环境监测系统察觉到，在一些使用“灵暗能”较为集中的区域，宇宙空间的微观结构出现了极其细微的变化。这种变化最初几乎难以察觉，但随着时间的推移，变化的幅度逐渐增大。与此同时，一些依赖“灵暗能”的生物科技实验也出现了异常结果，实验生物的生长周期和基因表达出现了一些难以解释的偏差。
联盟的科研团队立刻对这些现象展开深入研究。他们发现，这些异常似乎都与“灵暗能”在宇宙空间中的长期积累有关。虽然“灵暗能”在能源利用方面表现出色，但长期大量使用后，其释放出的能量余晖会对宇宙空间的微观结构产生影响，进而干扰生物体内的基因活动。如果这种情况得不到有效控制，可能会引发一系列严重的后果，如宇宙空间的不稳定以及生物多样性的受损。
联盟内部的激烈讨论
科研团队的发现引起了联盟与灵幻文明的高度重视，双方紧急召开联合会议商讨应对策略。在会议上，各方代表提出了不同的观点和应对方案，展开了激烈的讨论。
一部分代表认为，鉴于“灵暗能”可能带来的严重后果，应该立即大幅减少“灵暗能”的使用，寻找替代能源。他们强调，不能因为眼前的繁荣而忽视了潜在的巨大风险。“我们必须当机立断，‘灵暗能’的隐患已经显现，继续使用无异于饮鸩止渴。”一位代表言辞激烈地说道。
然而，另一部分代表则认为，“灵暗能”对联盟与灵幻文明的发展至关重要，目前还没有找到能够完全替代它的能源。他们主张加大对“灵暗能”的研究力度，寻找解决其负面影响的方法，而不是简单地放弃。“‘灵暗能’是我们科技发展的重要成果，不能轻易舍弃。我们应该相信科研的力量，一定能找到解决问题的办法。”另一位代表反驳道。
灵幻文明的代表也表达了他们的看法。他们认为，双方在合作开发“灵暗能”的过程中投入了大量的资源和精力，现在放弃实在可惜。同时，灵幻文明愿意与联盟共同承担责任，一起寻找解决方案。
慕悦星认真听取了各方意见，她深知这是一个艰难的抉择。一方面要考虑到“灵暗能”带来的巨大发展机遇，另一方面又要警惕其可能引发的严重危机。经过深思熟虑，她提出了一个综合应对方案：首先，成立一个专门的“灵暗能问题研究小组”，集中双方最优秀的科研力量，全力寻找解决“灵暗能”负面影响的方法；其次，在研究期间，对“灵暗能”的使用进行严格限制和监管，确保其使用量控制在一个相对安全的范围内；最后，同步开展对替代能源的探索研究，以防“灵暗能”问题无法得到有效解决。
科研攻关的艰难历程
“灵暗能问题研究小组”迅速组建并投入工作。科研人员在各个出现异常现象的区域建立了研究基地，对“灵暗能”在宇宙空间中的能量余晖进行详细的监测和分析。他们利用先进的粒子探测器和空间显微镜，试图弄清楚能量余晖是如何影响宇宙空间微观结构的。
经过长时间的研究，科研人员发现，“灵暗能”的能量余晖会在宇宙空间中形成一种特殊的能量场，这种能量场会干扰空间中基本粒子的正常运动，从而导致空间微观结构的变化。而对于生物体内基因活动的干扰，则是因为这种能量场影响了生物体内的能量传递和信号传导过程。
为了解决这些问题，科研人员尝试了各种方法。他们首先想到的是通过调整“灵暗能”的释放方式，减少能量余晖的产生。然而，经过多次试验，发现这种方法虽然能在一定程度上减轻影响，但无法从根本上解决问题。
接着，科研人员又尝试利用其他能量形式来中和“灵暗能”的能量余晖。他们对各种已知的能量进行了筛选和测试，包括光能、热能、电磁能等，但都没有取得理想的效果。